Obie pompy znajdują szerokie zastosowanie w przemyśle chemicznym, farmaceutycznym, nuklearnym, lotniczym i innych urządzeniach. Jeśli chodzi o zastosowania domowe lub dominują pompy w puszkach, powodem jest głównie to, że krajowa technologia materiałów ze stali magnetycznej nie została jeszcze przepuszczona, co często prowadzi do rozmagnesowania pomp magnetycznych, przeciążenia cieplnego i innych wypadków, ale stosowanie pomp magnetycznych w innych krajach jest nadal bardzo dojrzały.
Wspólny punkt pompy magnetycznej i pompy w puszce:
oba należą do pompy szczelnej, oba nie mają żadnego uszczelnienia wału.

Różnica między pompą magnetyczną a pompą w puszce:zasada konstrukcji jest zupełnie inna.
◆ Pompa w puszce wykorzystuje bezpośrednio zasadę działania silnika elektrycznego, natomiast energia zużywana przez silnik pompy magnetycznej musi być transportowana do wirnika poprzez magnesy wewnętrzne i zewnętrzne (część energii jest przekształcana w ogrzewanie magnesów), dzięki czemu wydajność pompy w puszce jest teoretycznie wyższa niż pompa magnetyczna.
◆ Z konstrukcji widać, największą wadą pompy w puszce jest to, że nie można jej naprawić (jest to bardzo trudne), a zastosowanie procesu powoduje problemy z korpusem pompy lub silnikiem, a użytkownik w zasadzie nie jest w stanie samodzielnie naprawić. Oraz naprawa pomp magnetycznych nie różni się zbytnio od zwykłych pomp. łożyska silnika pompy w puszce stykające się z medium, zarówno trudne w rutynowej konserwacji, jak i trudne do naprawy, uszkodzenia łożyska nie można wykryć w celu zaobserwowania zjawiska awarii i aury, trudno jest znaleźć ukryte niebezpieczeństwo podczas pracy, gdy problem wystąpi to śmiertelne uszkodzenie.
◆ Grubość tulei izolacyjnej pompy magnetycznej jest ponad 3 razy większa niż w przypadku pompy w puszce, co gwarantuje większą szczelność i niezawodność.

◆ Łożyska silnika pompy są smarowane medium, a jej silnik nie posiada wentylatora, a odprowadzanie ciepła z silnika odbywa się poprzez wewnętrzny obieg medium. Prowadzi to do wyższej awaryjności tego silnika w obudowie. Silnik pompy magnetycznej to zwykły silnik, oparty na chłodzeniu wentylatorem, dojrzały i niezawodny. Ale także z powodu tego hałasu pompy magnetycznej niż pompa w puszkach.
◆ Pompa w puszce ma bardziej zwartą konstrukcję, więc jej rozmiar jest mniejszy niż pompa magnetyczna, aby zaoszczędzić miejsce.
◆ Pompy w puszce nie mają sprzęgła, pompy magnetyczne i silniki są połączone sprzęgłem i muszą być wycentrowane.
◆ Ze względu na materiał magnetyczny maksymalna moc pomp magnetycznych jest niższa niż pomp w puszkach, co prowadzi do ograniczeń pomp magnetycznych w stosowaniu dużych obciążeń powodowanych przez niektóre duże natężenia przepływu i wysokie ciśnienia.
◆ Pompy magnetyczne są bardziej odpowiednie do mediów silnie korozyjnych niż pompy w puszkach ze względu na grubszą tuleję izolacyjną (pompy w puszkach z grubszą tuleją ekranującą będą miały wpływ na działanie elektromagnetyczne uzwojenia stojana i uzwojenia wirnika).
◆ Do mediów zawierających cząsteczki metalu (np. opiłki żelaza) nie można używać pomp magnetycznych, ponieważ materiał ferromagnetyczny będzie przyciągany przez stal magnetyczną, co spowoduje awarię. A pompa w puszce sobie z tym poradzi.
